初夏、友達と下校中だった高校生・永井圭は、交通事故に遭い轢死するがすぐに生き返り、決して死なない「亜人」だと判明する。
亜人のテロリストである佐藤が亜人に対して政府や民間企業が行ってきた非人道的な研究を世間に暴露し、「大量虐殺して亜人の力を国民に認めさせる」という目的に向かう亜人の同志を見つけて殺害予告リストを公表、田中や奥山・高橋・ゲンといった仲間たちとテロを起こしながら世間を恐怖のどん底に陥れた。
平穏な暮らしを取り戻したい圭は、佐藤に反発する亜人の少年・中野 攻と行動を共にすることとなり、政府機関である亜人管理委員会の戸崎 優やその部下で亜人の下村 泉らとチームを組んで佐藤を止めるために行動を開始する。
佐藤の脅威と恐怖を目の当たりにした厚労大臣が弱腰になり佐藤との和解に舵を切る一方、独自に動いた戸崎たちは亜人研究の第一人者・オグラ博士を味方にしながら作戦を練るが、フォージ安全ビルでの死闘で完全敗北を喫してしまう。
一方、少年院では圭の逃走を助けた幼馴染のカイが同房の少年・琴吹を助けたことで協力を得ることに成功。
亜人である琴吹は翼のあるIBMで、助けてもらった恩返しにカイを一度だけ少年院から脱獄させることを約束するのだった。
最終ウェーブとして日本の統治を掲げる佐藤がいつ動くかもわからない中、圭たちは佐藤を止めるラストチャンスである亜人管理委員会と佐藤達の会談の場所へと向かう。
しかし会談の場に姿を現したのは強硬に流血沙汰を回避しようとしていた田中だけだった。
佐藤の侵入に気づいた三尉が部下たちを率いて戦闘態勢に入るなか、戸崎も邪魔者である曾我部を排除し、それぞれの戦いの場へと向かうなか、泉が佐藤に裏切られた田中を救出して味方に引き入れ、田中の情報を元に監禁されていた亜人の消防士・秋山も味方に加わった。
一方、基地では佐藤達が集めた一般人の同志たちも奇襲に加わり、混乱の隙を突いて高橋とゲンが基地に侵入し、総理をシェルターに閉じ込める。
そして佐藤自身は本気の自衛隊と死闘を繰り広げた上に部隊を壊滅させ、いよいよ革命決行に着手する。
自力で基地内に侵入を果たした圭は佐藤を止めることができるのか―。
13巻のあらすじを振り返ってみましょう。以下ネタバレ注意です。
奥山が佐藤一派から離反
入間基地を制圧した佐藤はAJIN.comで新たなメッセージを後悔し、「2時間で日本の重要機関を全て沈黙させる」という最終ウェーブの開始を宣言。
その頃、消防士の秋山を救出した攻はちょうど息を吹き返した奥山と遭遇する。
奥山は飄々と佐藤を裏切る考えを明かし、「きっと役に立つ」とケータイを差し出した。
危険人物である佐藤を刺激しないためにあえて行動を共にしていた奥山だが、インフラが整った日本での生活を壊さないためにここが引き際と判断。
秋山たちにケータイを託し、自分は全てのデータを削除して雲隠れするのだった。
戦闘機に乗った佐藤、最終ウェーブ開始
泉・田中・攻・秋山は圭と連絡を取りながら入間基地へ急行。
佐藤の宣言を知った圭は佐藤の行動を読むため、一度佐藤に近づくことを狙う。
その頃佐藤は奥山と連絡が取れなくなったことから奥山がバックレたことを悟るが、おかまいなしに計画を進めていた。
圭は佐藤が基地祭で並べられていたたくさんの戦闘機に乗ることを推測して滑走路に出ると、佐藤は人質にしていた総理らを殺害してまさに戦闘機に乗り込んで発進に入る所だった。
そして圭が見つめるそのすぐ上を佐藤が離陸、飛び立っていく。
滑走路から戦闘機が飛び立つところと、滑走路に圭がいるところは報道ヘリから中継され、少年院にいるカイも圭が今どこで何をしているかを知る所となるのだった。
佐藤の狙いは自爆特攻の連続攻撃だった
危険を冒してまで佐藤に近づいた圭は、その考えを読み取ることに成功した。
佐藤の作戦は、基地に大きい肉片を残してから戦闘機で国の重要機関に自爆特攻、死んで入間基地に戻るというループを繰り返して何度も特攻することにあった。
最初に狙われたのは国会議事堂、戦闘機のスピードでなら入間基地から42秒で着くことができる。
そして離陸する際に圭が見たのは左腕がない佐藤の姿、つまり左腕を基地のどこかに残して発進したということ。
攻撃を知る時間さえないまま国会議事堂が自爆特攻を受け、招集されていた総理代理である5人全員と自衛隊のトップが死亡。
国のトップを失った日本はいま、重要な決定を下せる人間がいなくなった。
佐藤の左腕を奪え
事態を注視していたコウマ陸佐は上官の命令を無視して「対亜人特選群」の出動を指示、入間基地に向かわせる。
その頃、圭は「佐藤を止めない」という作戦を立てて仲間たちに作戦を伝える。
佐藤が戦闘機に乗ってどこかへ向かっている間は佐藤と戦闘するリスクを回避でき、その隙に佐藤の残した左腕を見つけて奪取する作戦。
奪った左腕を排水管のような狭い穴に入れたところに佐藤が復活すれば、佐藤は全く身動きが取れなくなるというものである。
そして佐藤の腕の場所のヒントは、秋山が奥山から入手したケータイの位置情報アプリにあった。
佐藤の仲間がいると思われるのは3か所。
攻と秋山、泉と田中、そして圭が3手に分かれて捜索することとなる。
圭は作戦を伝えきる前に佐藤の仲間の一般人たちに銃撃を受けてしまうが、ちょうどそこに対亜人特選群が到着。
圭は対亜人特選群と共に前進を開始するのだった。
カイが少年院を脱走
秋山と攻、泉と田中はそれぞれの目標地点で佐藤の仲間である亜人と接敵し、IBM同士の戦闘に入る。
他方、佐藤のテロの様子をTVで見ていたカイと琴吹。
琴吹は「外に出してやる」とカイに告げ、草むしりの時間にカイは壁に向かって突然走り出す。
琴吹は翼を持ったIBMでカイを掴んで飛び上がり、そのまま一直線に入間基地の方角へと向かうのだった。
【13巻のまとめ】
奥山が佐藤一派から離反する一方、佐藤は戦闘機に乗って国の重要機関に次々と自爆特攻を仕掛ける最終ウェーブを開始。
国会議事堂が最初に狙われて国のトップを担う人物たちが命を落とすなか、圭は佐藤が復活するために基地内に残していた左腕の肉片に目をつけ、それを奪取すべく動き出す。
攻と秋山、泉と田中がそれぞれ左腕を探して佐藤一派の亜人と戦闘に入り、圭も出動した対亜人特選群と共に基地の奥へと前進。
同じころ、基地での様子をテレビで見ていたカイは琴吹の協力により翼を持ったIBMで少年院から脱走、一直線に入間基地へと向かうのだった。
次巻へ続きます。
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